とある魔術の禁書目録

アカデミーシティには、230 万人の住民のうち 80% が学生ですが、その先進性は世界中の他のどの国よりも進んでいます。住民は超常的な能力に目覚め、それはレベル 0 から 5 まで評価されます。そんな中には、能力を持たないレベル 0 の超能力者・上条 当麻がいます。彼の能力は無意味だと認識されていますが、彼は右手に「イマジン・ブレイカー」という不思議な現象を持っており、超常の力に触れるとそれを無効化することができます。それでも、彼は彼に頻繁に起きる不幸から「腐った運勢」を持っていると主張しています。ある日、自分をインデックス・リブロルム・プロヒビトーラムと名乗る少女が、魔法使いに追われているとして、何も知らずにそのバルコニーにやってきます。これが超能力を持たない少年を、魔法が存在するという全く新しい世界へと導くことになりました。科学的側面と魔法の両方から生じる課題に直面する当麻は、どのようにそれらを解決するのでしょうか？